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9 de septiembre de 2026

ADN y CRISPR, átomo a átomo

Cómo encuentra Cas9 su sitio, cómo corta y por qué no se va: CRISPR con los átomos en su sitio.

Qué estás viendo

Una hebra de ADN y la proteína Cas9 dibujadas átomo a átomo, donde cada punto es un electrón colocado según la física de su átomo. El reel arranca en la maraña de ADN de un núcleo, baja hasta los nucleosomas (el ADN enrollado sobre carretes de proteínas) y llega a la doble hélice. Ahí se ve a Cas9 chocando una y otra vez hasta dar con su sitio, palpando la señal PAM, abriendo la hélice para comparar letra a letra con su ARN y, al final, cortando las dos hebras.

De dónde salen los datos

Las moléculas son estructuras reales del Protein Data Bank: por ejemplo, Cas9 agarrando el PAM (4UN3) o la serie de estados en los que va abriendo la hélice. Midiendo en esas estructuras se ve el seguro del sistema: la parte que corta no se coloca hasta que la comprobación pasa de 10 letras, así que si la secuencia falla antes, no puede cortar. La maraña del principio es una simulación de 233.000 letras de ADN empaquetado, el 0,004 % de lo que hay en una célula. Y en bacterias se ha medido que una sola molécula de Cas9 tarda unas 6 horas en encontrar su objetivo (Jones et al., Science 2017).

Lo que no se ve

Lo que no se suele contar: después de cortar, Cas9 no se va. Se queda horas sujetando el corte y hace falta que otra proteína la arranque; primero suelta un extremo y retiene el otro mucho más tiempo. La cromatina del principio no es la fibra de 30 nm de los libros de texto, porque esa estructura no aparece dentro de las células (Ou et al., Science 2017): he modelado cadenas desordenadas, que es lo que se ha observado. Los movimientos entre estructuras son interpolaciones entre estados medidos, no una película de la proteína real, y cosas como el agua que ataca el enlace o el orden exacto de los dos cortes siguen sin estar resueltas del todo.

Pieza original de Óliver Nabani (@olivernabani), publicada por primera vez en Instagram el 9 de septiembre de 2026. No se permite volver a subirla sin permiso.

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